يتكون الهيكل التنظيمي لوحدة ريادة الأعمال وصندوق رعاية المبتكرين والنوابغ التابعة لمركز إدارة المشروعات والابتكار وريادة الأعمال والتصنيف الدولي بجامعة الزقازيق من وحدتين كما يلي: